核战后的穹顶社会看似安稳，实则暗流涌动。底层青年林野一直和养父老周在穹顶底层艰难求生。一次外出任务，林野遭遇强大的王兽，混乱之中误服王兽髓液，基因被辐射能量改写，觉醒了特殊异能。 觉醒之后，林野很快被黑尘会盯上。黑尘会首领顾宸看中他的特殊体质，想要抓捕他，将他作为核心样本，推进自己的计划：把穹顶里三百万居民全部投入融合实验，批量制造异能强者，淘汰普通人类，建立只有觉醒者的新世界。 林野在苏晚的协助下，一边适应体内不稳定的异能能量、忍受觉醒带来的剧痛，一边躲避黑尘会追捕，同时和鳄鱼怪、巨型树人等各类畸变兽厮杀，也有机甲大战巨兽的戏份。随着调查深入，穹顶内部防线被黑尘会攻破，穹顶沦陷。林野被迫逃出穹顶，去往危险的辐射废土寻找稳住异能的办法。 最终决战来临，顾宸的阴谋全面铺开。激战当中，林野的养父老周为保护他不幸牺牲。巨大悲痛之下，林野选择和废土中的树人力量融合，爆发出极强力量，重创顾宸，粉碎了这一轮献祭三百万人的实验阴谋。影片结尾，危机并没有完全结束，林野下定决心，重返危机重重的穹顶，继续拯救幸存者。
